特定の地域に飛来する鳥類の種類や数、利用の状況、繁殖の有無等を調査します。対象とする鳥類はオオタカ、クマタカなどの猛禽類、繁殖や越冬のため日本に渡来しているヤイロチョウ、ナベヅル、コアジサシ、オシドリなど、多岐にわたります。
現地調査は、それぞれの鳥類の特性に合わせて任意観察法、ルートセンサス法、定点観察法などを組み合わせて行います。
また、調査結果をGIS（地理情報システム）等を用いて解析し、環境アセスメント・事業による影響のモニタリング、自然環境の保全・再生計画の策定、重要種の保全にかかわる対策の提案などを行います。

【主な調査実績】
・鳥類の生息状況調査（河川水辺の国勢調査）
・環境アセスメント（各種事業の鳥類に対する予測・評価・保全対策の検討）
・事業実施に伴うモニタリング調査
・重要鳥類（ヤイロチョウ・ナベヅル・オシドリ・コアジサシ等）の飛来状況調査